Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR5P51681 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR5P51681 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR5P51681 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR5P51681 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR5P51681 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR5P51681 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR5P51681 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR5P51681 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms