Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms