Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4P46934 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms