Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNT2P45379 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms