Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms