Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MDH1P40925 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms