Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms