Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA4P35212 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJA4P35212 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms