Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms