Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK1P29120 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK1P29120 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK1P29120 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK1P29120 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK1P29120 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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