Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms