Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1P21675 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1P21675 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1P21675 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1P21675 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1P21675 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms