Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB8P17481 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms