Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSP16219 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms