Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms