Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms