Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP1P09455 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms