Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNB1P01574 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms