Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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