Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms