Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms