Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1AO15047 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1AO15047 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1AO15047 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD1AO15047 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms