Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms