Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms