Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms