Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms