Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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