Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144AA2RUR9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms