Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DTX4Q9Y2E6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms