Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms