Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms