Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC7AQ9ULT0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms