Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBE1Q9UJT0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms