Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms