Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD5Q9P267 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms