Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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