Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TBCCD1Q9NVR7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms