Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms