Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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