Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLCO1B3Q9NPD5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms