Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms