Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms