Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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