Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms