Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC13A1Q9BZW2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms