Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms