Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms