Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms