Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms