Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms